Наслідки Кримської війни
На початку Кримської війни в монастирі розміщувався штаб флоту, для чого були влаштовані два кам'яні двоповерхові корпуси для флотського керівництва.
Під час оборони Севастополя в 1854-1855 р.р.
на території монастиря господарювали французи і англійці. Храм відвідували лорд Реглан, генерали Симпсон, Кондрингтон, Канробер, Пеліпсьє, і навіть, турецький головнокомандувач Омер-Паша. Англо-французські війська в монастир прибули 14 вересня 1854 року. Настоятель монастиря Геронтій та 12 ченців протягом одного року і одинадцяти місяців не покидали обитель. Служби не припинялися. Старотці, що відреклися від миру сього, протягом двох років вставали і лягали під гуркіт снарядів. Французи зайняли два монастирські готелі під госпіталь і житло воєначальників. Третя будівля з квітня 1855 року використовувалася під телеграфну станцію, що зв'язувала підводним кабелем командування союзників з Лондоном і Парижем.Для охорони осідки були виділені солдати за наказом французького головнокомандувача маршала Сент-Арно. Все необхідне для життєдіяльності – свічки, мука для просфор, ладан, вино – регулярно доставлялося за розпорядженням англо-французского штабу. Офіцери союзників нерідко відвідували монастирську церкву і молилися в ній.
Зачаровувані красою обителі, французи називали її "другою Італією". Відомий випадок, коли турецький головнокомандуючий Омер-Паша, прибувши в монастир, схотів ввійти і оглянути церкву Воздвиження Чесного Хреста, але був в головному уборі і французькі охоронці запропонували йому і офіцерам оголити голови.
Інші ченці, окрім згаданих 12 чоловік, брали участь в захисті Севастополя. Особливо відзначилися два ієромонахи Іоанникії - Іоанникій (Савінов) і Іоанникій (Добротворський). Ієромонах Іоанникій (Савінов), що належав до 45-го флотського екіпажу, за мужність був нагороджений найрідкіснішим для священнослужителя орденом Св.
Георгія 4-го ступеня. Найбільш відомим його подвигом була його участь у вилазці загону генерал-лейтенанта Хрульова для руйнування ворожих робіт, що близько підійшли до Камчатського люнету на Корабельній стороні. Коли французи були вибиті із захоплених люнетів, камчатці, днепровці і волынці кинулися на ворожі апроші, де зав'язався бій. Французи, що отримали підкріплення, почали вже тіснити наших, коли пролунав спів: "Врятуй, Господи, люди твоя і поблагослови надбання Твоє, перемоги благовірному Імператору нашому на супротивні даруючи і Тебе зберігаючи хрестом Твоїм проживання", - так співав батько Іоанникій в епітрахилі і з піднятим хрестом в руках. Його вигляд збентежив ворога, а спів підбадьорив своїх солдатів, які з новою силою кинулися в атаку. Один із зуавів спробував заколоти священика багнетом, але був убитий юнкером Камчатського полку Негребіцьким. У Ієрм. Іоанникія була пошкоджена лише спітрахиль і лівий рукав ряси.... Французи бігли з першої, потім з другої лінії траншей.Тоді чернець звернув увагу на поранених і помираючих і своїх, і ворогів. Під час напуття вмираючих куля ударила в хрест ієромонаха, відбивши і відкинувши убік нижню частину святині, сам же Іоанникій від контузії знепритомнів, але незабаром прийшов до пам’яті і продовжував напучувати вмираючих.
Ієромонах був викликаний генерал-лейтенантом Хрульовим, щоб передати солдатам його наказ залишити ворожі траншеї, оскільки солдати, збуджені перемогою, не вірили сигналу відступу, вважаючи що сигнал поданий ворогом. Солдати підкорилися священику і повернулися в ті, що відняли у французів, ложементи. Ієрм. Іоанникій (Добротворський) був священиком при 44-у флотському екіпажі. З початку оборони Севастополя він щодня обходив траншеї і батареї з хрестом в руках, вселяючи мужність в солдатів. В нічному бою з 2-го на 3-е березня він, відшукуючи свій батальйон в ланцюзі 1-го батальйону Камчатського полку, опинився в самій гущавині бою - і всю ніч хрестом підбадьорював солдатів, напучував вмираючих і утішав поранених. Причащаючи поранених, він відшукав серед ворожих трупів пораненого ворожого офіцера, полонив його і здав військовому начальству. Відомо, що він викликав охочих на вилазки і не раз особисто бував разом з ними в розвідці.
Після закінчення кампанії всіх флотських ієромонахів і братію монастиря нагородили медалями "За захист Севастополя", "В пам'ять війни 1853-1856 гг.", а також спеціально встановленим для духівництва наперсним хрестом на Володимирській стрічці "В пам'ять війни 1853-1856 рр." з написом "На Тя, Господи, уповахом, так не посоромимося вовіки".
۞